биоинформатика
-
Хабрахабр
Многоуровневое моделирование работы мозга
Человеческий мозг является одной из самых сложных и загадочных структур во вселенной. Он содержит около 80 миллиардов нейронов, которые взаимодействуют друг с другом, создавая сложные сети и обрабатывая огромное количество информации. Но какие процессы регулируют работу отдельных нейронов и как происходит поддержание функционирования столь масштабной биологической сети? Моделирование человеческого мозга является святым граалем современной нейробиологии, предоставляющим инструмент для понимания того,…
Читать далее » -
Хабрахабр
Может ли биолог починить радио? 20 лет спустя
2002 в журнале Cancer Cell вышла весьма саркастическая статья Юрия Лазебника «Может ли биолог починить радиоприемник, или что я понял, изучая апоптоз». За 20 лет много изменилось. Биологи создали графический язык SBGN (Systems Biology Graphical Notation) для представления структуры биохимических путей и XML формат SBML (Systems Biology Markup Language) для представления математических моделей. Кроме самих стандартов, необходимо программное обеспечение, которое…
Читать далее » -
Хабрахабр
Как подсчитать медведей с помощью термодинамики? Рецепт простой: много фотоловушек, две ложки компьютерного зрения и щеп
▎Привет, Хабр! В этой статье я хотел бы рассказать о том, как с помощью разных современных технологий и фишечек можно решить одну из злободневных проблем современной экологической науки – подсчет численности видов.Вот уже много лет ученые-экологи по всему миру ломают голову над вроде бы простым вопросом: как подсчитать животных? Казалось бы, что тут сложного? Ведь нужно просто пересчитать всех…
Читать далее » -
Хабрахабр
Почему я не хочу продолжать работу в биотехе
(Ближе к сути - 3 Глава) Глава 1. Если бы не реальность у меня все было бы хорошо Немного бекграунда, я никогда не мечтала стать биологом. Я родилась в семье медиков, с детства меня интересовало как устроены мы, люди или другие живые организмы. Мои родители подогревали мой интерес довольно подробными описаниями устройства организмов, ответами на вопросы “почему так, а не…
Читать далее » -
Хабрахабр
Биоинформатика: IT vs рак
Универсального лечения от онкологических заболеваний не существует до сих пор, однако биоинформатики работают с колоссальным объемом данных, чтобы в том числе разрабатывать новые методы лечения и диагностики рака. Но есть одна незадача: рак – это общий термин, обозначающий большую группу сложных многофакторных заболеваний, на развитие которых влияет и окружающая среда и генетика. Он может проявиться у любого человека в любой…
Читать далее » -
Хабрахабр
JetBrains Education: предсказание побочных эффектов лекарств
Привет, Хабр! Меня зовут Елена Картышева, я выпускница программы «Разработка программного обеспечения» Университета ИТМО — одной из образовательных инициатив JetBrains. Я занимаюсь биоинформатикой и машинным обучением, и сегодня хочу рассказать о своей выпускной квалификационной работе. В рамках диплома я улучшила модель предсказания совместных побочных эффектов лекарств. Это поможет разрабатывать более эффективный дизайн клинических исследований и собирать информацию о побочных эффектах…
Читать далее » -
Хабрахабр
AlphaFold2: глубокий разум и его правильное применение
Диана Кондинская, руководитель отдела структурной биоинформатики BIOCAD, рассказывает про алгоритм AlphaFold2 от компании DeepMind. Введение Если вы когда-то слышали про биоинформатику, вычислительную биологию, структуру белка и проблему фолдинга, то вы знаете, о чем мы здесь будем рассказывать. Если вы интересуетесь глубоким обучением и нейросетями, их применением для решения насущных практических задач и глубоко убеждены, что искусственный интеллект если и не…
Читать далее » -
Хабрахабр
Научно-исследовательские инициативы JetBrains
«Develop with pleasure», «The drive to develop» — об этом вы наверняка от нас слышали. Но наши интересы далеко не ограничиваются разработкой и созданием мощных инструментов для повышения продуктивности. Мы верим, что можем многое изменить и сделать мир лучше. Один из верных способов — проведение исследований в области передовых технологий и образования. Совместно с ведущими научными учреждениями мира мы занимается…
Читать далее » -
Хабрахабр
Запрограммировано ли старение? Разбираем доказательства
Гипотеза о том, что старение запрограммировано весьма популярна среди обывателей, но имеет довольно мало сторонников среди ученых-геронтологов. При этом данная гипотеза кажется весьма логичной, на первый взгляд. Откуда такое расхождение? Может быть, ученые просто находятся в плену своих предубеждений и когнитивных ошибок, не давая зеленый свет смелой гипотезе? "Ничто в биологии не имеет смысла, кроме как в свете эволюции" Добржанский…
Читать далее » -
Хабрахабр
Медведи, хомяки, человекоподобные. Хомяк или медведь брат человеку с точки зрения биоинформатики?
Чтобы ответить на этот вопрос, в научном исследовании необходимо определиться с целью, задачами и методами, и изучаемыми материалами. Для этого нужно постараться предварительно поставить гипотезу, которая облегчит нам понимание того, чего мы хотим, а следовательно, позволит нам выбирать материалы исследования. В качестве гипотезы можно опираться на ваши знания в области классификации групп животных. Однако, если у Вас нет таких знаний…
Читать далее »