Железо

Новая статья: ПаВТ-2018: как байты к флопсам ходили

На мероприятии традиционно было представлено множество докладов как прикладного — в большей степени, так и теоретического характера. В начале апреля в Ростове-на-Дону прошла очередная, уже двенадцатая по счёту ежегодная международная научная конференция «Параллельные вычислительные технологии (ПаВТ) — 2018», посвящённая тому, что, собственно говоря, вынесено в её название. Ну и суперкомпьютерным технологиям, в частности. Увы, в этот раз удалось побывать только на пленарных докладах первого дня, которые были объединены одной простой идеей, рассмотренной с нескольких сторон, — нам нужно повышать эффективность использования ресурсов суперкомпьютеров.  Все они будут вскоре выложены на сайте конференции.

Суперкомпьютер Anton (Фото: Wikipedia)

Суперкомпьютер Anton (Фото: Wikipedia)

Во-первых, проблема собственно вычислительной мощности стоит уже не так остро, есть и другие важные аспекты. Глобально здесь можно выделить два направления. Напротив, ресурсов сейчас много, но ведь надо ещё и уметь работать с ними. Во-вторых, уже нет задачи по возможности обходиться малыми ресурсами. К проблемам, связанным с доступом к данным, к непосредственно интерфейсам. Конечно, всем надо ещё больше петафлопсов, и побыстрее, но фокус в последнее время сместился в несколько иную сторону. На уровне, близком к самим вычислительным блокам, это проблему пытаются решить увеличением числа каналов, объёма и скорости локальной памяти. Про заветный показатель в один байт на флоп уже давно особо не вспоминают. Это касается и CPU, и ускорителей: первые уже предлагают 6-8 каналов и объём в 1,5-2 Тбайт RAM на один процессорный разъём, у вторых же мы видим всё возрастающие объёмы стековой памяти.

В CPU растёт число линий PCI Express, а NVIDIA, недовольная производительностью PCI-E, развивает собственный интерфейс NVLink. Поднимаемся на уровень выше и видим всё ту же картину — увеличение возможной ввода-вывода. Совместимый стандарт (Open)CAPI развивает IBM. Мы уже неоднократно писали и про то, что PCI-E становится бутылочным горлышком для I/O, и про слишком долгую задержку выхода нового стандарта. Ну и про универсальность работы с ними за счёт CUDA или OpenACC. Собственно, NVIDIA в своём небольшом докладе на ПаВТ-2018 в очередной раз напомнила о своём широком ассортименте ускорителей: от решений для встраиваемых систем (для самоуправляемых авто, например) до мощных Tesla для HPC и дата-центров. Заодно кратко перечислили HPC-новинки GTC 2018, главная из которых, на мой взгляд, — внутренний интерконнект NVSwitch, о котором тоже есть отдельная заметка.

Естественно, все «горячие» данные хранятся на all-flash СХД, а теперь ещё и с использованием Optane. Линии PCI-E нужны для быстрого интерконнекта, то есть для эффективного обмена данными между узлами, и, конечно, для подключения NVMe SSD. Про всё это — тоже уже не в первый раз — рассказала Intel в своём докладе. Следующий шаг — переход к высокоплотным системам с NVMe-over-fabric, впервые показанным полтора года назад. Речь шла о «перебалансировке» самой платформы. В целом вся концепция развития окончательно была публично сформулирована во время презентации Intel Xeon Skylake-SP и платформы Purley. Новые CPU в дополнение к увеличенному числу ядер и смене внутренней шины получили варианты с поддержкой расширенного объёма RAM и встроенным интерфейсом Omni-Path (OPA), став ещё более похожими на Xeon Phi. Кроме того, они же получили новые встроенные средства для работы с хранилищем: Intel Volume Management Device (VMD) для обслуживания NVMe-накопителей и RAID-контроллер VROC.

Всё это вместе и составляет основу для создания программно-определяемых хранилищ (SDS, Software Defined Storage): NVMe-over-fabric вообще и NVMe-over-OPA в частности. Также в старших чипсетах платформы появилась поддержка сетей до 40 Гбит/с в базовой комплектации, функции для RDMA и аппаратное ускорение некоторых типичных сетевых операций. Однако у Intel есть ещё один козырь — модули Optane, которые можно использовать и в качестве отдельного хранилища, и для кеша, и для бесшовного «расширения» основной RAM на всех узлах с помощью Intel Memory Drive Technology. AMD же, например, просто предоставляет большее число линий PCI-E (128 в одно- и двухсокетном варианте), оставляя на выбор пользователя набор адаптеров для интерконнекта и/или хранилища. Так или иначе, всё это указывает на серьёзный сдвиг, переосмысление современных HPC-инсталляций.  Все эти технологии ещё и сдобрены солидным программным стеком.

В последнем списке Топ-50, с объявления которого и началась ПаВТ-2018, он присутствует аж трижды. Самый «свежий» суперкомпьютер в России, установленный в ОИЯИ, построен как раз с учётом этих веяний. Таких машин с гетерогенной структурой и современным «железом» в мире сейчас не очень много. И это неслучайно, потому что технически у него есть три вычислительных системы: одна на базе классических CPU Intel Xeon Gold 6154 (18 ядер, 36 потоков, 3/3,7 ГГц) + модули с Intel Xeon Phi 7290 (72 ядра, 288 потоков, 1,5/1,7 ГГц) + пять узлов NVIDIA DGX-1 с ускорителями Volta. Строго говоря, узлы DGX-1 «живут» отдельно от остальных. Итоговая теоретическая производительность кластера Intel составляет до 1 Пфлос FP32 или 500 Тфлопс FP64. А вот Intel-узлы «РСК Торнадо» как раз таки объединены Omni-Path (адаптеры 100 Гбит/с стоят в каждом из них), поверх которой и работает распределённое хранилище на базе NVMe-over-fabric.

Таким образом, например, процессор в одном узле может прозрачно и, что главное, быстро обратиться к накопителю на другом узле. В узлах установлены NVMe-накопители Intel SSD DC P4511 (2 × 1 Тбайт), которые дополнены классическими SATA-дисками Intel SSD DC S3520. РСК отдельно отмечает, что коммутатор Omni-Path Edge Switch 100, как и сами узлы и их компоненты, оснащён СЖО с охлаждением горячей водой (+45 °C на входе в узел, в пике до +57 °C). Ну или наоборот, данные можно локализовать в непосредственной близости от самого вычислителя. Итоговый среднегодовой коэффициент PUE составляет менее 1,06, а в идеальном случае достигает 1,027, что делает суперкомпьютер в ОИЯИ самой энергоэффективной HPC-системой в РФ. Внешний контур охлаждения использует технологию фрикулинга, которая действенна при температуре атмосферного воздуха ниже +50 °C.

Но в этом деле есть и другой, не менее важный аспект. Всё вместе позволяет более эффективно использовать вычислительные и энергоресурсы. Если говорить проще, то проект посвящён, например, увеличению эффективности работы программ на современных суперкомпьютерах. На прошлых конференциях ПаВТ уже звучали доклады об AlgoWiki — «открытой энциклопедии на русском и английском языках по свойствам алгоритмов и особенностям их реализации на различных программно-аппаратных платформах, цель которой в том, чтобы дать исчерпывающее описание алгоритма, которое поможет оценить его потенциал применительно к конкретной параллельной вычислительной платформе». В. Руководят проектом В. Воеводин (НИВЦ и ВМК МГУ) и Джек Донгарра (Jack Dongarra, соавтор LINPACK и TOP500).

Гораздо лучше использовать уже проверенные современные решения, чем изобретать свой велосипед. Сейчас исследователи работают над новой классификацией алгоритмов, которая должна помочь программистам в работе с реальными HPC-системами. Для них, в свою очередь, есть подборка известных алгоритмов, для каждого из которых могут существовать десятки конкретных реализаций, рассчитанных на особенности «железа» и его окружения. Классификация подразумевает иерархическое построение от задачи, для которой выбирается конкретный метод или методы. На первый взгляд всё это звучит просто, но на практике любая реальная задача разбивается на множество подзадач со своими методами и алгоритмами, которые и сами по себе могут опираться на другие методы и алгоритмы. В том числе и с учетом нюансов, связанных с вводом-выводом, о которых говорилось выше.

Может статься, что внутри него есть не один и не два оптимальных пути решения поставленной задачи — и AlgoWiki поможет в этом разобраться. В итоге образуется весьма ветвистое дерево. Претензии к TOP500 и к HPL — в частности, к размеру задачи в стандартной версии бенчмарка — звучат уже давно. Впрочем, в связи с этим поднимается и другой, более фундаментальный вопрос: нам интересно не только повышение эффективности использования HPC-систем, не менее важно и правильно оценивать эту эффективность. У обоих списков есть «зелёные» версии, учитывающие энергоэффективность, а косвенно — и экономическую составляющую работы суперкомпьютера. В качестве альтернативы возник рейтинг Graph500, который ориентирован на оценку работы с большими объёмами данных, что гораздо ближе к практике. Наконец, не так давно появился комплексный бенчмарк HPCG, который заметно изменил оценку расстановки сил в мире суперкомпьютеров, что важно в том и числе для имиджа стран.

Не стоит ли отталкиваться от конкретных практических задач и оценивать, насколько хороши они решены как программистами, так и создателями «железа». Авторы AlgoWiki предлагают задуматься, не стоит ли сменить сам подход к подобного рода рейтингам. И далеко не всегда номинанты обладали «железом», лидирующем в том же TOP500. Похожие мысли  на SC’17высказывал Гордон Белл (Gordon Bell), создатель легендарных машин PDP, который уже 30 лет присуждает собственную скромную премию за выдающиеся достижения в области высокопроизводительных вычислений. Они используются для расчётов в области молекулярной динамики и применяются медиками и биологами для исследований. Да и вообще, слышали ли вы когда-нибудь, например, о машинах Anton — узкоспециализированных суперкомпьютерах с уникальной архитектурой? Не это ли важнее всего? Машины эти не очень-то вписываются в имеющиеся HPC-рейтинги, однако приносят реальную пользу на практике.

Теги
Показать больше

Похожие статьи

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *

Кнопка «Наверх»
Закрыть