Главная » Hi-Tech » Инструмент редактирования генов CRISPR поможет найти новые антибиотики

Инструмент редактирования генов CRISPR поможет найти новые антибиотики

Они планируют лучше понять существующие антибиотики или разработать новые. Исследователи из Университета Висконсин-Мэдисон и их коллеги из Калифорнийского университета в Сан-Франциско применили инструмент редактирования генов для изучения, какие гены затрагивают конкретные антибиотики. Резистентность болезнетворных патогенов к существующим антибиотикам является растущей проблемой, которая, по оценкам, может поставить под угрозу миллионы жизней.

Проблема устойчивости к антибиотикам

Техника под названием Mobile-CRISPRi позволяет ученым проводить скрининг функции антибиотиков у широкого спектра патогенных бактерий. «Нам нужно выяснить новые слабости этих бактерий», говорит Джейсон Питерс, разработавший систему.

Эта простота переноса делает технику просто благом для ученых, изучающих бактерии, вызывающих заболевания или, напротив, способствующих укреплению здоровья. В процессе формы бактериального секса ученые передавали Mobile-CRISPRi из обычных лабораторных штаммов разнообразным бактериям, включая даже малоизученного микроба, обитающего на сырной корке.

Эта система снижает выработку белка у целевых генов, позволяя ученым определить, как антибиотики подавляют рост патогенных микроорганизмов. Питерс работал с Кэрол Гросс, Ореном Розенбергом и другими коллегами, разрабатывая Mobile-CRISPRi. Эти знания могут помочь непосредственным исследованиям антибиотикорезистентности.

Они воспользовались преимуществами набирающего популярность молекулярного инструмента CRISPR, но уникальным способом. Работа ученых была опубликована 7 января в журнале Nature Microbiology.

«Но это не то, чем я занимаюсь». «Большинство людей, когда они думают о CRISPR, думают о редактировании генов», говорит Питерс.

Ген можно редактировать, пока клетка восстанавливает повреждение. Обычно система CRISPR нацеливается на ген, в котором разрезает ДНК пополам.

CRISPRi проектировался так, чтобы не разрешать ДНК. Но Питерс и его сотрудники работали с модифицированной формой CRISPR — CRISPRi. Результатом стала сниженная экспрессия гена и сниженное количество белка, который им кодируется. Вместо этого, он просто садится на ДНК, блокируя доступ других белков к определенному гену.

Таким образом, тысячи генов одновременно могут быть подвергнуты скринингу в качестве потенциальных мишеней для антибиотиков, помогая ученым узнать, как работают антибиотики, и как их улучшить. Ученые показали, что если уменьшить количество белка, на которое нацелен антибиотик, бактерии становятся намного более чувствительными к более низким уровням препарата — что свидетельствует о связи между геном и препаратом.

Команда Питерса воспользовалась одним из природных способов обмена ДНК между бактериями, что-то вроде бактериального секса, конъюгацией. Чтобы сделать CRISPRi мобильным, ученые разработали метода переноса системы из обычных лабораторных моделей вроде кишечной палочки болезнетворным видам, которые зачастую труднее изучать.

«Проще не бывает». «Вы просто смешиваете бактерии вместе и все получается», говорит Питерс.

Используя конъюгацию, команда Питерса передала Mobile-CRISPRi патогенам Pseudomonas, Salmonella, Staphylococcus и Listeria, среди прочих.

«Мы могли бы лучше узнать, как эти препараты воздействуют на разные организмы и, возможно, сделать их лучше». «Это означает, что теперь вы можете изучать, как антибиотики воздействуют непосредственно на эти патогены», говорит Питерс.

Расскажите в нашем чате в Телеграме. Как думаете, какие еще применения мы найдем CRISPR?


Оставить комментарий

Ваш email нигде не будет показан
Обязательные для заполнения поля помечены *

*

x

Ещё Hi-Tech Интересное!

«Коммерсантъ»: Huawei до конца года запустит в России собственный музыкальный сервис

«Коммерсантъ»: Huawei до конца года запустит в России собственный музыкальный сервис — Медиа на vc.ru Свежее Вакансии Написать Уведомлений пока нет Пишите хорошие статьи, комментируйте,и здесь станет не так пусто Войти Источник говорит, что её стоимость будет на уровне Apple ...

Итоги презентации Apple: что показали и пообещали выпустить в этом году

И вышедшему на сцену главе компании Тиму Куку действительно было что показать. Сегодняшняя презентация компании Apple проходила под слоганом «It’s show time», что можно перевести как «Время для шоу» или «Время для показа». Мы увидели обновленные iPad mini и iPad ...